В области изучения чумы:

• установлены основные закономерности энзоотии чумы, используемые в эпиднадзоре;
• разработаны новые методы лабораторного исследования повышенной специфичности и чувствительности;
• определён механизм естественной изменчивостиYersiniapestis – мутагенез под действием фагоцитирующих клеток хозяина (носителя);
• определён механизм селекции Y. pestis – соответствие уровня популяционной вирулентности возбудителя уровню популяционной резистентности носителя (хозяина) в природном очаге;
• разработаны новые критерии популяционной дифференциации чумного микроба;
• определён механизм трансмиссии Y. pestis;
• определён механизм энзоотии чумы;
• разработаны рациональные схемы этиотропной и патогенетической терапии чумы;
• с использованием биотехнологии разработаны новые диагностикумы на основе моноклональных антител;
• разработаны методы определения генетического полиморфизма носителей чумы для эпизоотологического картирования территории;
• в практику научных исследований свойств возбудителя чумы внедрены молекулярные методы: полимеразная цепная реакция (ПЦР), иммуноблот, плазмидный профиль;
• выявлена новая дополнительная плазмида возбудителя чумы;
• собрана коллекция из 1100 уникальных штаммов из очагов чумы Казахстана, зарубежья;
• собрана коллекция  из 35 природных фагов чумного микроба;
• определён механизм длительного существования возбудителя чумы вне организма носителей в симбиозе с почвенными бактериями;
• разработана современная концепция эпиднадзора за чумой;
• разработана методология направленного конструирования вакцинных штаммов;
• определены особенности клеточного иммунитета для специфической профилактики чумы;
• дано научное обоснование стратегии полевой профилактики чумы;
• разработано теоретическое обоснование оздоровления горных очагов чумы надёжными, экологичными и рентабельными методами, которыми оздоровлен Тянь-Шанский очаг чумы;
• разработан, апробирован и внедрён в практику метод полевой дезинсекции путем дустации нор грызунов (сурки, песчанки);
• разработана и запущена в серийное производство специальная аппаратура для проведения полевой дезинсекции, в частности аэрозоляторы АЛ-1, пружинные дустеры для дезинсекции нор сурков и др.;
• разработана компьютерная программа «AutoMap» по составлению карт-схем природных очагов чумы с учётом их паспортизации;
• для прогнозирования эпизоотий чумы используются фенетические методы;
• разработан метод построения табличных вычислительных математических моделей эпизоотического процесса и прогнозирования;
• разработаны принципы и категории оценки противоэпидемической эффективности полевой дезинсекции;
• разработан и внедрён в практику наиболее экономичный метод экстренной профилактики чумы путём создания защитных зон вокруг населенных пунктов методами полевой дезинсекции;
• среди большого количества современных пестицидов подобраны, изучены и апробированы инсектициды, наиболее подходящие для целей полевой профилактики чумы;
• решена проблема гостальности природных очагов чумы и предложена новая классификация носителей и переносчиков чумы;
• разработана уникальная программа «БИОСТАТ», в которой предусмотрены все необходимые функциональные возможности для сбора, накопления, хранения и квалифицированного анализа получаемых при эпизоотологическом обследовании материалов;
• установлено современное распространение серой крысы на территории Казахстана и соседнего Кыргызстана; осуществляется слежение за продолжающимся расселением этого вида в Алматинской и Жамбылской областях и обусловленными им изменениями ситуации по природноочаговым инфекциям;
• разработаны новые методы локализации и ликвидации очагов чумы людей;
• разработана новая схема лечения чумы, эффективная для лечения терминальных и осложненных форм инфекции, апробированная на практике;
• осуществлено  ландшафтно-эпизоотологическое районирование природных очагов чумы Казахстана и Центральной Азии, позволяющее дифференцированное проведение эпиднадзора.

В области других инфекций:

• разработан метод серологического зондирования при зоонозах;
• выявлены природные очаги лептоспироза, псевдотуберкулёза, кишечного иерсиниоза, пастереллёза, геморрагических лихорадок, туляремии;
• разработаны методы тестирования холерного вибриона на вирулентность;
• разработаны новые селективные среды;
• разработана и внедрена автоматизированная информационно-поисковая система по эпиднадзору за холерой «Санэпид»;
• испытано отношение современных штаммов к 34 антибактериальным препаратам различных групп, производимых зарубежными фирмами;
• разработана схема лечения и химиопрофилактики современной холеры наиболее эффективными препаратами;
• открыта новая раса возбудителя туляремии, названная именем М.А. Айкимбаева;
• определены условия антропогенной конверсии очагов туляремии и усовершенствована диагностика этой инфекции;
• обнаружена и описана циркуляция эритромицинчувствительного биовара голарктического подвида возбудителя туляремии в очагах туляремии Центрального Казахстана;
• установлены и изучены новые природные очаги туляремии в Тургайской, Жезказганской, Актюбинской и Кокшетауской областях;
• совместно с санитарно-эпидемиологическими учреждениями  систематизирована в едином справочном пособии, в Кадастре стационарно-неблагополучных по сибирской язве пунктов (2002 г.), информация о стационарно неблагополучных по сибирской язве пунктах на территории Казахстана;
• изучены таксономические признаки и отношение к антибиотикам штаммов возбудителя туляремии, циркулирующих в природных очагах Казахстана;
• разработана и внедрена в практику селективная среда для обнаружения   возбудителя туляремии в биологических объектах и внешней среде;
• разработана холерная дифференциальная жидкая питательная среда;
• разработана элективная питательная среда для получения холерогена;
• разработаны параметры лиофильного высушивания живой туляремийной вакцины из аттенуированного штамма  туляремийного микроба среднеазиатского подвида КА-29. Изучены на животных иммуногенная активность, приживаемость, подлинность и другие свойства экспериментальной туляремийной живой вакцины среднеазиатского подвида;
• определена эпидемическая значимость биологических свойств сибиреязвенного, листериозного, туляремийного микробов;
• определена чувствительность возбудителей некоторых зоонозов  к новым антибактериальным препаратам;
• изучены бактерицидные и спороцидные свойства новых дезинфектантов;
• разработана программа регуляции численности грызунов в г. Алматы;
• внедрена в практику ПЦР для обнаружения возбудителей туляремии и сибирской язвы в объектах внешней среды и биологических объектах.